Jeżeli właściciel akwarium nie traktuje go wyłącznie jako kolejnego przedmiotu na wyposażeniu pokoju, przed uruchomieniem zbiornika powinien przemyśleć kwestię doboru odpowiedniej fauny i flory, w kontekście wody którą dysponuje, czyli w praktyce w odniesieniu do parametrów wody kranowej. Akwarysta powinien sprawdzić jakie wymagania mają ryby i rośliny, które zamierza trzymać w zbiorniku. Można to sprawdzić np. na stronie www.akwafoto.pl, będącej kopalnią usystematyzowanej wiedzy odnośnie wymagań ryb i roślin akwariowych. Przemyślane podejście do zakupu roślin a głównie ryb, pozwoli zaoszczędzić męki zwierzętom a właścicielowi akwarium, cieszyć się pięknymi widokami w akwarium.
Akwaryści uruchamiający akwaria morskie, zawsze stają przed problemem „skąd wziąć wodę do akwarium morskiego”. Wodę taką napraktyczniej jest produkować we własnym zakresie. Współczesne filtry do wody pozwalają na uzyskanie wody demineralizowanej niskim kosztem. Woda taka jest idealną bazą do przygotowania wody do akwarium morskiego. Oczywiście rodzaj używanych urządzeń powinien wynikać z wielkości akwarium i cech technicznych (np. otwarte akwarium to większe ubytki wody przez parowanie). Pomijając duże zapotrzebowanie na wodę w momencie uruchamiania zbiornika, w późniejszym czasie zwykle nie są potrzebne duże ilości wody do podmian.
W warunkach domowych najprostszą metodą jest filtracja wody metodą odwróconej osmozy (RO) z końcowym jej doczyszczeniem na złożu DEMI. W ofercie sklepów z filtrami do wody, znajdują się urządzenia, pozwalające na skuteczne oczyszczanie wody na potrzeby akwariów morskich.
Akwarystyczne filtry odwróconej osmozy, ogólną zasadą działania przypominają filtry do wody pitnej, jednak z uwagi na odmienny sposób użytkowania, konstrukcja takich filtrów jest z reguły prostsza. Sama zasada działania metody uzdatniania wody jest identyczna jak w przypadku kuchennych filtrów RO.